Ubuntuとのデュアルブートにした一番の理由がcoLinuxでaptが動かなくなったためだったのですが、
今日大学から試したら正常に動きやがりました；
何が問題だったかと言うと、
／var／lib／apt／lists
以下に生成されるはずのファイルが全て消えてしまい、
新たに作ることも出来なくなってしまった（作成してもapt実行時に削除される）ためです
直った理由は全く分かりません；
とにかく、これでUbuntuを起動する機会が減るのは決定的ですねー…orz
GRUBブートローダもWindowsを一番上にしといたほうがいいな…
横浜祭まで現Windows環境で進めて、その後はまた考えることにします